一些好用的tRFs数据库
栏目:最新研究动态 发布时间:2017-11-30
在几个恶性肿瘤中发现了几个trna衍生的片段,参与细胞增殖、凋亡和侵袭性转移......

在几个恶性肿瘤中发现了几个trna衍生的片段,参与细胞增殖、凋亡和侵袭性转移。这些失调的片段能够结合阿尔戈里的蛋白质和皮维蛋白来调节基因表达。一些新发现的trna基因片段被认为是治疗癌症的新生物标记和治疗靶点。本文综述了不同亚型的trna-衍生片段的生物起源和生物学功能,并讨论了它们在癌症进展中的分子机制。

tRFs( tRNA-derived fragments)是来源于tRNA前体或成熟的tRNA的非编码小片段。最近的一些研究表明tRFs在多种肿瘤中异常表达,有些tRFs参与了某些恶性肿瘤的细胞增殖、凋亡和侵袭转移,这些差异表达的tRFs主要通过结合AGO蛋白及PIWI蛋白调控基因的表达。此外一些研究表明tRFs还可以做肿瘤的biomarker及治疗靶点。随着越来越多的研究者的关注,tRF将成为下一个非编码RNA的研究热点。接下来小编为大家介绍几个tRF常用数据库,方便大家进行相关研究。

1、tRFdb   http://genome.bioch.virginia.edu/trfdb/search.php

tRFdb数据库主要收集了人,小鼠,线虫等7个物种的tRFs序列,总共2513条序列,其中人的序列552条, 收集的序列不多. 该数据库主要收集了tRF-1, tRF-3, tRF-5序列,并提供ID,序列两种查询方式.

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